据了解，由于受到不同地区、不同用户及国家能源政策、燃料价格的影响，水源热泵的运行效率较高、费用较低。但与传统的空调制冷取暖方式相比，不同地区不同需求的条件下，水源热泵的投资经济性会有所不同。
很好的热泵热源和空调冷源，水体的温度一年四季相对稳定。水体温度较恒定的特性，使得热泵机组运行更可靠、稳定，也保证了系统的高效性和经济性。不存在空气源热泵的冬季除霜等难点问题。据了解，一机多用，水源热泵系统可供暖、空调。一套系统可以替换原来的锅炉加空调的两套装置或系统。所以可以设计简单的系统，水源热泵机组由于工况稳定。部件较少，机组运行简单可靠，维护费用低;自动控制水平高，使用寿命长可达到15年以上。
由于水源热泵技术利用地表水作为空调机组的制冷制热的源，所以其具有以下优点：首先是环保效益显著，进行能量转换的供暖空调系统。供热时省去了燃煤、燃气、然油等锅炉房系统，水源热泵是利用了地表水作为冷热源。没有燃烧过程，防止了排烟污染;供冷时省去了冷却水塔，防止了冷却塔的噪音及霉菌污染。不产生任何废渣、废水、废气和烟尘，使环境更优美。
其次是高效节能，水体温度比环境空气温度高，水源热泵机组可利用的水体温度冬季为12-22℃。所以热泵循环的蒸发温度提高，能效比也提高。而夏季水体为18-35℃，水体温度比环境空气温度低，所以制冷的冷凝温度降低，使得冷却效果好于风冷式和冷却塔式，机组效率提高。据美国环保署EPA估计，设计装置良好的水源热泵，平均来说可以节约用户30%的供热制冷空调的运行费用。
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