要做好古镇历史文化遗产的保护工作，就必须做到：加强政府监管，科学规划，合理开发，扩大宣传，加强基础设施建设，改善生态与人文环境，加强相关立法与执法等。除此之外，还应着力做好以下三方面工作。
(一)政府加大资金投入
对古镇的历史文化遗产保护来说，加大资金投入是关键。长期以来，在古镇历史文化遗产保护方面，政府为主导，但在实际操作中，我们遗憾地看到，各级政府部门均以“资金缺乏”为由，将转换历史文化遗产保护模式完全等同于招商、出让经营权，引入社会资金与民间资金来进行旅游开发。“同时由于各开发实体在开发过程中思想上的不一致性和不协调性，也对古镇的后续发展产生了不良影响。坚持政府为主导的原则，并不排除创新古镇开发的投融资体制，只是在资本运营过程中，政府要加强其管理职能，制定相关的政策法规，实施统一规划、有效管理，’对不符合规定的做法坚决予以取缔和废除。”…古镇历史文化遗产保护的主体投资者应该是政府。政府不应该只充当“管理者”与“惩罚者”，更不能只满足于“税收”。政府部门应每年拨出一笔专款用于古镇的修缮和维护，以解决古镇历史文化遗产的保护问题。
(二)多学科介入保护
首先，要明晰古镇历史文化遗产保护的学科归属，这会使保护工作更具专业性，使科研任务得以明确到专业机构与人员，防止出现科研方面的推诿扯皮现象。
其次，在明确了学科归属的基础上，应鼓励多学科共同支撑，尤其是人文、社会科学的积极介入。古镇历史文化遗产保护是个系统工程，不仅仅是古建筑学者的独立任务，“不但要发挥建筑界主力军的作用，还须经济、旅游、地理、历史、生态文艺、民俗、司法等各个领域学者的共同参与通力合作。其中人文学者与建筑学家同样不可或缺。”¨古镇历史文化遗产保护涉及到的学科较多，“因此就需要相关多种学科的参与和努力，运用不同的方法进行保护，这就包括历史学、地理学、建筑学、社会学以及景观生态学等多学科的方法”。
其中，历史学研究方法的介入尤其重要。通过历史学的介入，深入挖掘、整理、研究古镇的历史进程，阐述古镇独特的文化内涵及其发展脉络，从而增强古镇文化主体——土著居民特别是年轻人的“文化认同”，唤醒并激发起他们的更深层次的“文化自觉”，引导他们主动地热爱古镇历史文化，并积极投入到古镇历史文化遗产保护的日常工作中去。
(三)积极申请加入《世界文化遗产名录》
首先，成为世界文化遗产，可以获得一笔固定的保护资金。其次，可以扩大古镇的知名度，加快创立民族品牌。通过这种更高层次的宣传，古镇的知名度会得到进一步的提升，可以使古镇持续保持对游客的吸引力，从而延续古镇的生命周期，有利于促进古镇旅游事业的可持续性发展。
目前，我国仍处于社会主义初级阶段，我们正大步行进在“进入现代化”的光明大道上。在现代化文明的强势推进下，我国古镇正面临着城市化的步步紧逼，而古镇的历史文化遗产保护也难以避免地出现了诸多危机。同时，部分西方国家已经或正在“走出现代化”。
追寻传统的精神家园，正在成为其社会中的一种精神时尚。建筑可以重塑，文化却不能复原。我们不希望看到：随着古屋老宅的纷纷倒下，其中的历史与文化也默默消亡。中国的古镇历史文化遗产是属于全人类的文化财富，让我们共携手、同努力，做好古镇历史文化遗产保护工作，共同守卫这静谧的心灵港湾。
